Для мелких собак(и кошек)-провоз разрешен только в купейных жестких вагонах с оплатой не более одного багажного места на один билет-в таре размером по совокупности размеров не более 180см. В одном багажном месте(в одном контейнере ) допускается не более двух мелких собак..В ПЛАЦКАРТНЫХ ВАГОНАХ ПЕРЕВОЗКА ДОМАШНИХ ЖИВОТНЫХ И ПТИЦ ОТНЫНЕ ЗАПРЕЩЕНА !
Провоз крупных(20кг и более) собак допускается только с сопровождающими, с выкупом всех мест в отдельном купе купейного вагона,при этом количество собак не может превышать количество всех мест в купе,но дополнительная оплата за собак не производится.
Для очень крупных собак разрешается провоз в тамбуре багажного вагона(не более 2-х собак на вагон)-в наморднике и на поводке,с сопровождающим. При этом оплата за провоз собаки не может превышать 25 процентов стоимости билета по направлению проезда.
Полностью приказ Минтранса по правилам перевозки животных РЖД можно прочесть на русфоруме.